目前，MatDEM软件主要包括以下两大模块：
A系统模块。1）主程序。运行二次开发代码和查看模拟参数；2）后处理。自动生成各类场图，过程曲线和模拟动画；3）材料。自动训练具有特定力学性质的离散元材料。
B应用模块。包含各类地质和岩土工程问题的建模示例，可修改示例二次开发代码建立新的数值模型。其中滑坡示例和离散元试验室示例已形成窗口界面。随着MatDEM的发展，将不断增加新的模块，满足各类复杂工程应用需求。

      MatDEM自1.3版提供了本地语言支持。基于访问数据，软件提供中文、英文、西班牙语、德语、法语和日语支持。在程序运行时即可切换语言，无需重新安装MatDEM。帮助文件包括中文和英文版本。

      矩阵离散元MatDEM软件的英文含义是Fast GPU Matrix computing of Discrete Element Method。软件名取其核心Mat和DEM，即矩阵离散元MatDEM。MatDEM算得快是基于矩阵离散元法，其为整个软件的基础与核心。这也是软件logo的由来，logo背景的正方网格代表矩阵计算和GPU的矩阵计算核心，中间为离散元的三个代表字母DEM，其中DM化为两个小球，通过E弹簧连接。DEM三个字母即构成了离散元简单的一种切向弹簧接触。整体颜色采用科技蓝代表GPU高性能计算。整个logo体现矩阵离散元GPU高性能计算的含义。