关注泰科科技 做模拟不迷路
哈姆雷特当然有很多心事，也许正因为如此，他不可能成为一个优秀的软件推销员。然而，作为一个软件开发人员，我们应该积极地看待他探索替代方案的愿望。即使在一个特定的范例中(让我们把自己限制在数据流水线上)，也不是只有一种方法可以做到这一点。
如果我们通过网络查看我们共享的关于数据管道的知识(参考文献1是一个很好的起点，当然也有很多链接)，我们可以找到各种各样的实现，可以追溯到50多年前。可视化编程范式实际上并不是在这场游戏的后期出现的(1966年是我发现的一份参考资料的日期)，尽管它在过去的五年中确实迅速发展起来。
可重用组件网络的概念可以被发挥到极致，它可以可视化地连接到管道中，并配置为执行特定任务。事实上，在作者所选择的数据流水线工具BIOVIA Pipeline Pilot中，作者最喜欢的工具条(如下图所示)显示了一点偶像崇拜的色彩。
What are the Components?
这两个圈起来的部件不是用它们的名称而只是用符号表示。它们的动作由过滤(拆分数据管道)和操作管道上的数据的抽象概念表示。
然而，这些都是基于脚本的组件(它们的确切名称是自定义操纵符(PilotScript)和自定义过滤器(PilotScript))。第一种方法允许对流经管道的数据进行任何基于脚本的操作，第二种方法允许使用类似的脚本，但使用最后的语句求值为布尔值，这将管道分为两个部分。
它们都为用户提供了一个相当不错的表达式编辑器，具有您所期望的一切(语法高亮显示，智能感知，查找&放大器;替换,等等)。在下面的图中，我们展示了点击热键时的表达式编辑器，它会提醒您在数据管道的那个点上有哪些属性可用:
这个特定的组件应用了PilotScript，这是Pipeline Pilot的原生脚本语言。但如果您喜欢Python或Java，则可以找到类似的组件。
但这不是一种亵渎吗?当我们可以使用正确配置的组件来完成我们需要的工作时，我们应该编写脚本吗?必须让我们停下来。
举个例子应该会有帮助。我们最近帮助某人修改了一些数据，这些数据具有个人发明的数据格式的通常特征，永远不会重新遇到(用空行分隔的记录组、莫名其妙的类似json的[和]等)。
第一步是使用数据和一些分组组件进行一些极端的编程，但我们很快意识到Pipeline Pilot也允许您编写脚本，几分钟内我们就得到了我们想要的东西。
Conclusion
当然，实现这一点的是脚本语言中可用的函数或方法。这就是为什么我们为Java和Python这样的大热门编写脚本。但是PilotScript也提供了很好的函数，从操作(可能是分层的)数据记录的函数集，到操作化学反应的函数集，再到操作组件本身的函数集(因此在可视化语言上进行编程，这是一个非常有用的功能)。
这就是它应该有的样子。作为开发人员，我们对自己的工具和技能有很好的了解，应该能够根据一时的冲动做出选择，而不是遵循任何范式。正如哈姆雷特所引用的:“不要因为思想的苍白而生病。”相信自己，抓住你本能地认为是正确的工具。只要确保你有一个完整的工具箱。
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针对药物设计、药物研发等提供基于Discovery Studio、COSMOLOGIC等软件的ADME、构象比对、溶剂筛选、结晶、成盐、共晶筛选、稳定性、溶解度pKa、分配系数等性质的模拟预测软件及方案。
化工设计
面向精细化工、新能源、石油化工等领域提供精馏萃取催化剂设计、热力学性质（溶解度、粘度等）、提纯表面处理吸附等性质模拟软件平台及解决方案。
数据挖掘
基于Pipeline Pilot提供数据搜集、数据清洗、特征工程、机器学习、流程设计等多种数据挖掘综合解决方案。
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• Pearson’s CD：晶体数据库
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2022年第37期应用实例赏析-02