MES系统与ERP、SRM、WMS、PDM、CAPP、PLM、APS是最常见的信息集成。目前，MES之间实现数据集成的方法主要有文件转换、数据复制、数据聚合、API接口、XML、数据集成平台等方式。
（1）中间文件转换
将数据从源数据库中导出，形成一个中间文件，然后将中间文件包含的数据导入到目标数据库中，这是信息化建设初级阶段最常用的方法。
（2）数据复制
数据复制应用在同构的数据库中，保持数据在不同数据模型中的一致性。数据复制中，需要建立不同数据模型中数据转化和传输的机制及关系，以屏蔽不同数据模型间的差异。
（3）数据聚合
数据聚合是一种将多个数据库和数据库模型聚合成为一种统一的数据库视图的方法，用户能够以访问数据库的通用方法访问任何相连的数据库。但是，构建一个适用于多种异构数据源的通用接口难度比较大。
（4）API接口
API接口目前在系统集成中使用非常普遍，而且许多软件本身具有API接口。两个应用系统之中的数据通过设在其间的应用适配器的接口进行传输，从而实现集成。
（5）XML
XML作为一种对数据格式进行描述的通用元语言标准，实现跨平台数据集成。
（6）消息中间件的集成模式
消息中间件是指利用高效可靠的消息传递机制进行与平台无关的数据交流，并给予数据通信实现分布式系统的集成。消息中间件可以实现跨平台操作，为不同操作系统上的应用软件集成提供服务。