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利用COSMO-RS模型筛选适合的离子液体作为绿色溶剂从微藻生物质中提取二十碳五烯酸(EPA)

关注泰科科技 做模拟不迷路 摘要 Omega-3多不饱和脂肪酸(PUFA),特别是二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA),对健康有很多好处,包括降低患癌症和心血管疾病的风险。

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利用COSMO-RS模型筛选适合的离子液体作为绿色溶剂从微藻生物质中提取二十碳五烯酸(EPA)

摘要

Omega-3多不饱和脂肪酸(PUFA),特别是二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA),对健康有很多好处,包括降低患癌症和心血管疾病的风险。最近,离子液体(ILs)在微藻脂类提取中的应用克服了常见的缺点,并带来了其他一些好处。迄今为止,利用盲液提取微藻脂质特别是多脂肪脂肪酸的研究还非常有限。目前工作的目的是筛选潜在的可应用于EPA提取的ILs。在本研究中,利用导体样实际溶剂(COSMO-RS)筛选模型进行了快速盲降筛选,并对具有较高容量值的盲降进行了比较。结果表明,其中EPA提取能力最高是从352个筛选的阳离子/阴离子筛选出的[tam][SO4]。将该组合溶剂应用于萃取过程中,有望获得较高的EPA收率。与较大阴离子相比,含有小阴离子的离子具有更高的容量和更高的电荷密度,因此,它们更适合用于萃取目的。此外,在使用咪唑基IL时,更倾向于使用较短的烷基链阳离子,这与实验数据一致。

 

引言

omega-3多不饱和脂肪酸(PUFAs),包括二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA)提供的健康益处尤其值得社会关注,因为它可以降低癌症、自身免疫、心血管疾病、炎症疾病、囊性纤维化、神经功能紊乱、肠道疾病和精神疾病的风险。最近,EPA和DHA的主要来源都来自鱼类,但由于鱼油中含有大量的维生素a和D,长期摄入鱼油可能会导致维生素E缺乏. 本研究采用cosmo-rs作为筛选方法,筛选出最适合微藻中EPA固液提取的盲液组分。这项工作的目的是在不使用任何实验数据的情况下预测EPA萃取的无限容量值。

 

 

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结果与讨论

EPA的化学结构及其sigma表面如图1所示。

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图2图3分别展示了sigma-profile and sigma-potential。与EPA分子定性描述相关的重要术语,包括氢键、极性和亲油性/亲水性,可以在COSMO-RS 3D筛选电荷分布(sigma表面)的帮助下可视化。

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在298.15K下筛选咪唑、吡啶、吡咯吡啶、哌啶、四甲基铵五种阳离子基ILs与22种阴离子的相关容量值,结果如图4a-e所示。

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但是,根据S=O的性质,可以认为S=O是EPA与OH形成氢键的良好质子受体(图5),因此,氢键(S=O)是可以被接受的。H)正离子和阴离子对之间的离子强。

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计算细节

根据密度泛函理论(DFT),利用turbomole 6.3程序包对分子几何结构进行优化,使用Becke和Perdew (BP)泛函B88-86生成COSMO文件,该B88-86具有三zeta价和极化(TZVP),并以单位标准近似(RI)分辨率作为基组。

 

本研究采用COSMO-RS方法筛选了352个ILs(22个阴离子-16个阳离子组合),并计算了其相关容量值。选定的ILs(具有较高的容量值)打算作为溶剂应用于EPA提取。图6说明了以下筛选步骤,并因此选择适当的IL用于提取总EPA化合物。

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总结

总之,基于本研究的结果,采用cosmo-rs方法筛选出适合微藻脂类提取的盲液。352种阳离子/阴离子组合中,提取EPA的能力最高的是[tam][SO4],其次是[tam][BMPIP][SO4]

 

BIOVIA溶剂化化学模型提供以下应用的软件

(1) COSMOtherm

该模型包含三个COSMOtherm组件,使用COSMO-RS方法预测广泛的性质。

 

可以计算纯液体的性质,如密度、沸点、闪点、分配系数,以及混合性质,如汽液平衡、液液平衡、溶解度、蒸气压、活度系数等。在工作流环境中集成COSMOtherm提高了COSMO-RS方法的筛选潜力。

 

可以筛选大量溶质、溶剂或溶剂混合物的性质,例如药物在大量溶剂中的溶解度。

 

(2) COSMOconf

COSMOconf组件是一个conformer生成工具。您可以使用预定义的标准过程来为cosmors生成最相关的符合器,也可以使用您自己的过程。

 

(3) COSMOperm

这一成分预测了溶质通过生物膜的渗透性。您可以选择一套预先定义的膜系统或使用自己的膜。

 

(4) COSMOplex

该组件提供了COSMO-RS方法的COSMOplex扩展。可以用它来计算非均匀系统的性质,例如,界面张力或临界胶束浓度,或创建新的生物膜系统。

 

(5) COSMOquick

COSMOquick碎片化技术可作为cosmors计算的一种快捷方法。该组件还可以用于应用预定义的QSPR模型或计算唯一的化学描述符。

 

(6) TURBOMOLE

该模型提供了一个组件,您可以使用TURBOMOLE1®程序包执行量子化学计算。

 

(7) COSMO DATABASES

可以将COSMO数据库集成在Pipeline试点中使用。这适用于BIOVIA COSMObase以及您自己的自定义COSMO文件数据库。一个特殊的组件可用于复合数据访问。

 

(8) READERS AND UTILITIES

溶剂化化学组分模型提供了一对读者和实用程序。可以使用COSMO文件读取器和TURBOMOLE coord文件读取器来访问特定的文件格式。预调节器可以帮助您确保正确设置其他组件所需的相关属性。

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北京泰科涉及行业

材料研发

基于BIOVIA Materials Studio材料设计平台,提供涉及电池、航空航天、国防军工、建筑、涂料涂层等多领域材料研发软件及综合解决方案。

 

药物研发

针对药物设计、药物研发等提供基于Discovery Studio、COSMOLOGIC等软件的ADME、构象比对、溶剂筛选、结晶、成盐、共晶筛选、稳定性、溶解度pKa、分配系数等性质的模拟预测软件及方案。

 

化工设计

面向精细化工、新能源、石油化工等领域提供精馏萃取催化剂设计、热力学性质(溶解度、粘度等)、提纯表面处理吸附等性质模拟软件平台及解决方案。

 

数据挖掘

基于Pipeline Pilot提供数据搜集、数据清洗、特征工程、机器学习、流程设计等多种数据挖掘综合解决方案。

 

一体化实验室

• 实验室信息管理

• 电子实验记录本/SOP执行

• 试剂耗材管理

• 仪器管理

• 数据管理

 

 

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部分产品

量化材料类

• Crystal:固体化学和物理性质计算软件

• Diamond:晶体结构数据可视化分析

• Endeavour:强大的求解晶体结构的软件

• Molpro:高精度量化软件

• Molcas:多参考态量软件                   

• Turbomole:快速稳定量化软件

• TeraChem:GPU上运行的量化计算软件

• Spartan:分子计算建模软件

 

数据分析类

• GelComparll:凝胶电泳图谱分析软件

• SimaPro:生命周期评估软件             

• Unscrambler:完整多变量数据分析和实验设计软件      

• CSDS:剑桥晶体结构数据库

• lCDD:国际衍射数据中心数据库

• ICSD:无机晶体结构数据库

• Pearson’s CD:晶体数据库

 

 

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公司简介

北京泰科博思科技有限公司(Beijing Tech-Box S&T Co. Ltd.)成立于2007年,是国内领先的分子模拟及虚拟仿真综合解决方案提供商。

 

北京泰科博思科技有限公司与国际领先的模拟软件厂商、开发团队深入合作,为高校、科研院所和企业在材料、化工、药物、生命科学、环境、人工智能及数据挖掘、虚拟仿真教学等领域提供专业的整体解决方案。用户根据需要在我们的平台上高效的进行各种模拟实验,指导实际的生产设计。

 

北京泰科博思科技有限公司拥有一支一流的技术服务团队和资深的专家咨询团队,以客户真正需求出发,服务客户,为客户创造价值。我们秉承“职业、敬业、担当、拼搏、合作”的企业精神,致力于用国际领先的软件产品和专业全面的技术支持服务,成为客户可信赖的合作伙伴。

2022年第34期应用实例赏析-01

 

 

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作者: suifengmianlai

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